Новое исследование: связь между раком и микробиомом оказалась слабее, чем считалось ранее

В последние годы микробиом человека рассматривался как одна из возможных ключевых переменных в развитии злокачественных опухолей. Сотни публикаций связывали бактерии, вирусы и грибы практически с любыми типами рака. Однако новое масштабное исследование специалистов Университета Джонса Хопкинса показало, что эта связь сильно преувеличена: в опухолевых образцах микробной ДНК оказалось значительно меньше, чем сообщалось ранее.

Анализ был проведён на основе данных The Cancer Genome Atlas (TCGA) — крупнейшей базы, включающей более 5700 образцов тканей при 25 видах рака. Учёные удалили из геномных данных все человеческие последовательности и тщательно отсеяли возможные загрязняющие примеси. В итоге доля микробной ДНК в солидных опухолях составила всего 0,57%, а в опухолях крови — 0,73%.

Результаты резко контрастировали с данными предыдущих работ. Одно из исследований, впоследствии отозванное, показывало в десятки и даже тысячи раз больше «микробных следов», которые, как выяснилось, в реальности были результатом лабораторных загрязнений. Например, ДНК пекарских дрожжей Saccharomyces cerevisiae и грибковый вирус Rosellinia necatrix partitivirus 8 попадали в образцы случайно и не имели отношения к онкологии.

Тем не менее исследователи подтвердили наличие микробов, давно ассоциированных с определёнными опухолями: ВПЧ связан с раком шейки матки и опухолями головы и шеи, Helicobacter pylori с раком желудка, Fusobacterium nucleatum и Bacteroides fragilis с колоректальным раком и другими опухолями ЖКТ.

Эти находки показывают: микробиом действительно может быть связан с отдельными типами рака, но масштаб этого влияния намного меньше, чем предполагалось. Большинство сигналов, зафиксированных в ранних исследованиях, были результатом технических артефактов.

Для медицинского сообщества выводы имеют принципиальное значение. Исследования микробиома должны учитывать высокую вероятность загрязнений. Диагностика рака по микробным следам требует строгой верификации. Необходимо разграничивать реальные связи, такие как ВПЧ и рак шейки матки, и ложные корреляции. Применение микробиомных тестов в клинике пока преждевременно.

Учёные подчеркивают: это не означает, что микробиом не играет роли в онкологии, но его значение ограничено и должно подтверждаться исключительно надёжными данными. Сейчас в фокусе остаётся тщательное документирование и повторная проверка всех результатов. Это особенно важно в свете растущего интереса к методам ранней диагностики рака, основанным на анализе микробиомных маркеров.

Данные секвенирования, полученные в исследовании Джонса Хопкинса, открыты для доступа, что позволит другим группам учёных продолжить работу и уточнить реальное место микробиома в онкологии.