Полногеномное секвенирование открывает новые возможности персонализированного лечения рака груди

Полногеномное секвенирование (Whole Genome Sequencing, WGS) становится мощным инструментом в борьбе с раком груди, открывая путь к действительно персонализированной медицине. Исследование учёных Кембриджского университета, опубликованное в журнале The Lancet Oncology, показало, что этот метод способен значительно увеличить число пациентов, которым можно подобрать индивидуальные методы лечения или включить в клинические исследования.

По данным Всемирной организации здравоохранения, в 2022 году рак груди был диагностирован более чем у 2,3 миллиона женщин, и около 670 тысяч умерли от этого заболевания. Несмотря на развитие онкологии, выбор оптимальной терапии для каждой пациентки остаётся сложной задачей, поскольку опухоли отличаются по генетическим особенностям и механизму развития.

Полногеномное секвенирование позволяет исследовать ДНК пациента и его опухоли, выявляя мутации и изменения, которые определяют рост и поведение раковых клеток. Это даёт возможность точнее определить причины возникновения опухоли, выявить потенциальные мишени для терапии, определить устойчивость к препаратам и оценить прогноз течения болезни.

Хотя стоимость технологии стремительно снижается — например, компания Ultima Genomics уже заявила о возможности секвенировать геном человека за 100 долларов, — она пока не получила широкого применения в Национальной службе здравоохранения Великобритании. Сегодня метод используется для лечения отдельных видов рака у взрослых, детей и редких форм заболевания.

Профессор Серена Ник-Зайнал из Кембриджского университета отмечает, что потенциал секвенирования пока используется не в полной мере. Это связано не только с нехваткой клинических данных, подтверждающих эффективность метода, но и с тем, что объём получаемой информации огромен и требует более совершенных инструментов для анализа.

Чтобы восполнить этот пробел, группа исследователей под руководством профессора Ник-Зайнал проанализировала данные почти 2500 женщин из Англии, участвовавших в проекте «100 000 геномов». Информация, собранная в Национальной библиотеке геномных исследований под управлением Genomics England, была объединена с клиническими сведениями и статистикой смертности, что позволило отследить результаты лечения в течение пяти лет.

Учёные искали генетические изменения, влияющие на развитие и течение рака груди. Анализ показал, что 27 процентов опухолей имеют особенности, которые могут помочь в выборе терапии или определении участия в клинических исследованиях. Это эквивалентно более чем 15 тысячам женщин ежегодно в Великобритании.

Среди обнаруженных особенностей: дефицит гомологической рекомбинации (HRD), встречающийся у 12 процентов пациенток; мутации, на которые действуют известные препараты; признаки устойчивости к гормональной терапии; мутационные сигнатуры, указывающие на потенциальные слабые места опухоли. Ещё 15 процентов случаев продемонстрировали изменения, представляющие интерес для будущих исследований, включая нарушения в других путях репарации ДНК. Это может помочь дополнительно восьми тысячам трёмстам женщинам в год.

Исследование также показало, что генетический анализ позволяет точнее прогнозировать исход болезни. При наиболее распространённом типе рака груди — ER+HER2-, который встречается примерно у 70 процентов пациенток, — были выявлены гены, связанные с более агрессивным течением заболевания. Например, структурные изменения ДНК, мутации в гене TP53 и подписи APOBEC оказались надёжными предикторами повышенного риска смерти. Эти данные оказались точнее традиционных клинических критериев, таких как возраст, стадия или степень злокачественности опухоли.

На основе результатов исследования была создана прогностическая модель, которая помогает врачам определять, кому требуется более агрессивное лечение, а кому можно снизить интенсивность терапии. По оценкам учёных, около 7500 женщин ежегодно с менее агрессивными формами рака могут извлечь пользу от корректировки схем лечения.

Профессор Ник-Зайнал подчеркнула, что Великобритания обладает всеми возможностями для внедрения полногеномного секвенирования в клиническую практику. Теперь, когда накоплены популяционные доказательства эффективности метода, открывается возможность улучшить жизнь тысяч пациенток, обеспечив им точный подбор терапии и более предсказуемые результаты лечения.

Кроме того, использование полногеномного секвенирования может радикально изменить подход к клиническим исследованиям. Сегодня участие в испытаниях возможно только при наличии определённой мутации, совпадающей с целью исследования. Однако при анализе полного генома врачи получают значительно больше данных, что позволяет приглашать пациенток сразу в несколько исследований и быстрее подбирать подходящие методы лечения.

Полногеномное секвенирование постепенно становится одним из главных направлений в современной онкологии. Этот подход не только повышает точность диагностики и прогноза, но и делает лечение рака груди максимально персонализированным, помогая тысячам женщин во всём мире получать именно ту терапию, которая соответствует их уникальному генетическому профилю.